以下是关于Chrome浏览器扩展程序权限设置未生效的排查指南的内容：
打开Chrome浏览器，在地址栏输入chrome://extensions/并按回车键，或者点击浏览器右上角三个点图标选择“扩展程序”。这个页面会显示所有已安装的插件及其当前状态。找到需要调整权限的那个扩展，点击它下面的“详情”按钮，这里能看到该插件请求的所有权限列表，比如能否读取浏览历史、修改网页内容等。仔细检查这些权限是否合理，如果发现有不必要的敏感权限（例如一个笔记类插件却要求访问摄像头），应该取消对应的勾选框。
有些不在官方商店发布的插件需要开启开发者模式才能安装。在扩展程序页面右上角找到并打开“开发者模式”开关，之后可以把本地下载好的.crx格式文件或解压后的文件夹直接拖到这个页面进行手动加载。系统可能会弹出安全警告，确认无误后即可完成安装过程。
进入chrome://settings/content/exceptions网址，查看是否有针对特定网站的全局限制影响了插件的功能发挥。可以尝试将某些可疑规则暂时设为“禁止”，然后重新给予权限，看看问题是否得到解决。同时确保你的Chrome已经是最新版本，过时的版本可能存在已知的权限管理漏洞。还要检查一下系统的时间和日期设置是否正确，错误的时钟可能导致证书验证失败从而引发权限异常。
部分安全防护软件如防火墙或杀毒软件可能会阻止插件正常获取所需权限。可以尝试暂时关闭这类程序测试一下效果，如果确实有效，那就把Chrome添加到信任名单里去。如果是企业用户并且受到了集中管理策略的限制（比如通过组策略模板强制执行某些规定），这时就需要联系公司的IT部门来协助修改相关设置了。
安装完毕后再次回到插件详情页，核实其实际获得的权限是否与预期一致。如果发现有不正常的情况（比如申请了一些没有明确说明的权限），最好马上卸载这款插件，并考虑联系开发者询问具体情况。另外定期清理浏览器缓存和Cookie也很有帮助，可以使用Ctrl+Shift+Delete快捷键快速完成这一操作，防止旧数据干扰新的权限配置。
当常规方法都无法解决问题时，可以尝试重置浏览器配置。先完全退出Chrome，然后找到个人资料文件夹（路径通常是C:\Users\你的用户名\AppData\Local\Google\Chrome\User Data\Default），在其中找到Secure Preferences文件，去掉它的“只读”属性后再重新启动浏览器。这样做有时会修复因配置文件损坏导致的权限问题。
按照上述步骤逐一排查，大多数情况下都能找出导致Chrome浏览器扩展程序权限设置不生效的原因并加以解决。关键在于系统化地测试每一个可能影响的因素，从插件本身的设置到外部环境的影响都要考虑到。